研究机构
| 国家级国际联合研究中心 | |
| 未来科学国际合作联合实验室 | |
| 国家基础科研与人才培养基地 | |
| 哲学基础学科人才培养和科学研究基地 | 历史学基础学科人才培养和科学研究基地 |
| 经济学基础人才培养基地 | 数学基础科学研究与教学人才培养基地 |
| 物理学基础科学研究与教学人才培养基地 | 化学基础科学研究与教学人才培养基地 |
| 生命科学与技术人才培养基地 | 机械基础课程教学基地 |
| 大学生文化素质教育基地 | |
| 国家高端智库 | |
| 东北与东北亚研究院 | |
| 教育部人文社会科学重点研究基地 | |
| 东北亚研究中心 | 边疆考古研究中心 |
| 数量经济研究中心 | 理论法学研究中心 |
| 中国国有经济研究中心 | 哲学基础理论研究中心 |
| 国家2011协同创新中心 | |
| 司法文明协同创新中心 | 出土文献与中国古代文明研究协同创新中心 |
| 国家文物局重点科研基地 | |
| 体质人类学与分子考古学科研基地 | |
| 吉林省协同创新中心 | |
| 东北亚区域研究协同创新中心 | |
| 吉林省社会科学重点领域研究基地 | |
| 东北亚国际语言文化研究基地 | 高校外语教育研究基地 |
| 吉林省人文社科重点研究基地 | |
| 社会公正与政府治理研究中心 | 创新管理研究中心 |
| 中俄区域合作研究中心 | 日本侵华史研究中心 |
| 廉政研究院 | 高句丽渤海研究中心 |
| 中国人口老龄化与经济社会发展研究中心 | 农村发展研究中心 |
| 文化遗产保护研究中心 | 中国文化研究所 |
| 中国特色社会主义理论研究中心 | 东北亚地缘政治经济研究所 |
| 社会发展研究中心 | 残疾人事业发展研究中心 |
| 犯罪治理研究中心 | 东北区域现代农业发展研究中心 |
| 劳动关系研究院 | 中国地方政府创新研究中心 |
| 吉林特色新型高校智库 | |
| 创新创业研究院 | 中国文化研究所 |
| 中国人口老龄化与经济社会发展研究中心 | 中国与俄罗斯及周边国家合作智库 |
| 廉政研究院 | 农村发展研究中心 |
| 残疾人事业发展研究中心 | 东北区域现代农业发展研究中心 |
| 高句丽渤海研究中心 | 犯罪治理研究中心（立项培育） |
| “985工程”科技创新平台 | |
| 物质制备科学科技创新平台 | 汽车工程科技创新平台 |
| 高压科学与技术科技创新平台 | 整合生物学科技创新平台 |
| 工程仿生科技创新平台 | 集成光电子学科技创新平台 |
| 东北资源与环境科技创新平台 | 计算与软件科学科技创新平台 |
| “985工程”哲学社会科学创新基地 | |
| 东北亚研究与东北振兴哲学社会科学创新基地 | 中国边疆史地哲学社会科学创新基地 |
| 经济分析与预测哲学社会科学创新基地 | 法律与经济全球化哲学社会科学创新基地 |
| 社会发展理论哲学社会科学创新基地 | |
| 国家工程实验室 | |||
| 艾滋病疫苗国家工程实验室 | |||
| 国家地方联合工程实验室 | |||
| 工程仿生国家地方联合工程实验室 | 中草药育种与栽培国家地方联合工程实验室 | ||
| 人类疾病动物模型国家地方联合工程实验室 | 高性能聚合物合成技术国家地方联合工程实验室 | ||
油页岩地下原位转化与钻采技术国家地方联合工程实验室 |
石油化工污染场地控制与修复技术国家地方联合 工程实验室 |
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| 国家级动物实验中心 | |||
| 长春市国家实验动物中心 | |||
| 国家工程技术研究中心 | |
| 国家地球物理探测仪器工程技术研究中心 |
| 国家重点实验室 | |
| 集成光电子国家重点联合实验室 | 超硬材料国家重点实验室 |
| 汽车底盘集成与仿生全国重点实验室 | 无机合成与制备化学国家重点实验室 |
| 超分子结构与材料国家重点实验室 | 人畜共患传染病重症诊治全国重点实验室（共建） |
| 教育部重点实验室 | |
| 符号计算与知识工程教育部重点实验室 | 分子酶学工程教育部重点实验室 |
| 工程仿生教育部重点实验室 | 汽车材料教育部重点实验室 |
| 病理生物学教育部重点实验室 | 地球信息探测仪器教育部重点实验室 |
| 人兽共患病研究教育部重点实验室 | 地下水资源与环境教育部重点实验室 |
| 新型电池物理与技术教育部重点实验室 | 器官再造与移植教育部重点实验室（筹） |
| 数控装备可靠性教育部重点实验室 | |
| 行业部委开放/重点实验室 | |||
| 原地矿部变质动力学开放研究实验室(国土资源部) | |||
| 原地矿部水资源评价管理系列模型开放研究实验室(国土资源部) | |||
| 原地矿部地球探测技术及仪器开放研究实验室 | |||
| 原地矿部功能矿物材料应用基础与物化性能检测方法开放研究实验室 | |||
| 原地矿部复杂条件钻进技术开放研究实验室 | |||
| 原矿业部应用地球物理综合解释理论开放研究实验室 | |||
| 地球探测技术及仪器国土资源部重点实验室 | |||
| 复杂条件钻采技术国土资源部重点实验室 | |||
| 应用地球物理国土资源部重点实验室 | |||
| 东北亚矿产资源评价国土资源部重点实验室 | |||
| 国家中医药管理局分子生物学三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局中药化学三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局中药药代动力学三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局中药生物工程三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局中药药理三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局中药药剂三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局免疫与分子生物学三级实验室 | |||
| 国家中医药管理局肿瘤细胞生物学三级实验室 | |||
| 卫生与计划生育委员会放射生物学重点实验室 | |||
| 原信息产业部计算机通信重点实验室 | |||
| 原信息产业部通信软科学重点实验室 | |||
| 原信息产业部原通信新技术重点实验室 | |||
| 原信息产业部信息科学重点实验室 | |||
| 微结构化学国际联合研究中心 | |||
| 工程仿生国际科技合作基地 | |||
| 表观遗传与人类疾病动物模型国际联合研究中心 | |||
| 新农村发展研究院（科技部、教育局） | |||
| 部级工程中心 |
| 特种工程塑料教育部工程中心（教育部） |
| 国家863计划长春特种工程塑料研究开发中心（科技部） |
| 汽车开发工程研究中心 |
| 特种工程塑料教育部工程中心 |
| 有机聚合物光电材料教育部工程研究中心 |
| 网络技术及应用软件教育部工程研究中心 |
| 地热资源开发技术与装备教育部工程研究中心 |
| 吉林省重点实验室 |
| 吉林省车辆零部件先进制造技术及系统重点实验室 |
| 吉林省工程仿生重点实验室 |
| 吉林省生物识别新技术重点实验室 |
| 吉林省道路交通创新重点实验室 |
| 吉林省重大疾病分子与化学遗传学重点实验室 |
| 吉林省酵母表达重组蛋白质药物研发重点实验室 |
| 吉林省分子病毒学重点实验室 |
| 吉林省水资源与水环境重点实验室 |
| 吉林省牙发育及颌骨重塑与再生重点实验室 |
| 吉林省应用原子分子光谱重点实验室 |
| 吉林省生物医学材料重点实验室 |
| 吉林省油页岩与共生能源矿产重点实验室 |
| 吉林省组织修复重建与再生重点实验室 |
| 吉林省外科转化医学重点实验室 |
| 吉林省组织工程与人类疾病动物模型重点实验室 |
| 先进气体传感器重点实验室 |
| 吉林省营养与功能食品重点实验室 |
| 吉林省工程技术研究中心 | |
| 吉林省高压技术与功能材料工程技术中心 | 吉林省测控智能化仪器工程技术中心 |
| 吉林省金网络模具工程研究中心 | 吉林省干细胞工程研究中心 |
| 吉林省汽车材料工程研究中心 | 吉林省光谱分析仪器工程技术中心 |
| 吉林省智能信号识别和设备工程技术研究中心 | |
| 吉林省通信软件产品线工程技术研究中心 | |
| 吉林省医学影像工程技术研究中心 | |
| 吉林省兽药工程技术研究中心 | |
| 吉林省东北保护性耕作系统工程技术研究中心 | |
| 吉林省科技创新中心 | |
| 吉林省特种工程塑料科技创新中心 | 吉林省网络通信软件科技创新中心 |
| 吉林省纳米孔材料科技创新中心 | 吉林省地球探测仪器装备科技创新中心 |
| 吉林省工程仿生科技创新中心 | 吉林省干细胞组织工程科技创新中心 |
| 吉林省生物纳米分子临床诊断创新平台 | 吉林省生物治疗科技创新中心 |
| 吉林省先进控制与自主系统科技创新中心 | 吉林省新药临床前药理评价科技创新中心 |
| 吉林省胸部疾病诊疗三维模拟应用科技创新中心 | |
| 吉林省工程实验室 | |
| 吉林省整车开发与底盘匹配工程实验室 | 吉林省仿生工程工程实验室 |
| 吉林省生物催化与生物转化工程实验室 | 吉林省纳米纤维工程实验室 |
| 吉林省汽车传动工程实验室 | 吉林省有机白光照明工程实验室 |
| 吉林省中草药道地性保护研究工程实验室 | 吉林省社区人群健康护理工程实验室 |
| 吉林省光通信用聚合物波导器件工程实验室 | 吉林省基因工程药物工程实验室 |
| 吉林省职能化农产品生产装备与技术工程实验室 | 吉林省汽车能源与动力工程实验室 |
| 吉林省地下空间探测工程实验室 | 吉林省肿瘤组织芯片工程实验室 |
| 吉林省糖尿病并发症工程实验室 | 吉林省新能源材料与技术工程实验室 |
| 吉林省生物药物研发与评价工程实验室 | 吉林省消化内镜医学微创工程实验室 |
| 吉林省呼吸疾病分子诊疗工程实验室 | 吉林省给药系统技术工程实验室 |
| 吉林省甲状腺疾病防治工程实验室 | 吉林省纳米医学工程实验室 |
| 吉林省智能化口腔治疗技术工程实验室 | 吉林省电子商务关键支撑技术工程实验室 |
| 吉林省环境岩土工程实验室 | 吉林省油页岩勘探开发利用工程实验室 |
| 吉林省移动平台探测技术与装备工程实验室 | 吉林省抗肿瘤药物工程实验室 |
| 吉林省洁净能源材料工程实验室 | 吉林省个体化医学检测技术工程实验室 |
| 吉林省内皮功能及基因诊断工程实验室 | 吉林省肝胆胰疾病转化医学工程实验室 |
| 吉林省肝癌早期诊断技术工程实验室 | 吉林省内分泌代谢性疾病诊疗技术工程实验室 |
| 吉林省工程研究中心 | |
| 吉林省汽车零部件制造技术工程研究中心 | 吉林省现代疫苗工程研究中心 |
| 吉林省组织修复与再生医学工程研究中心 | 吉林省网络技术及应用软件工程研究中心 |
| 吉林省动物生物工程研究中心 | 吉林省天然药物药理药效与应用开发工程研究中心 |
| 吉林省医用生物材料工程研究中心 | 吉林省功能食品工程研究中心 |
| 吉林省肿瘤疫苗工程研究中心 | 吉林省通信新技术工程研究中心 |
| 吉林省动物重大疫情诊断与防控中心 | 吉林省人参创新药物开发工程研究中心 |
| 吉林省现代检测技术工程研究中心 | 吉林省资源微生物工程研究中心 |
| 吉林省生物质资源利用工程研究中心 | 吉林省车辆运用装备工程研究中心 |
| 吉林省激光器驱动与控制工程研究中心 | 吉林省干细胞研究与应用工程研究中心 |
| 吉林省灵芝规范化种植及新产品开发工程研究中心 | 吉林省固体废弃物资源化利用工程研究中心 |
| 吉林省重离子放射治疗技术工程研究中心 | 吉林省兽用生物制品工程研究中心 |
| 吉林省汽车新能源与节能热利用工程研究中心 | 吉林省高性能计算工程研究中心 |
| 吉林省机电装备可靠性技术工程研究中心 | 吉林省模式动物工程研究中心 |
| 吉林省红外气体传感技术工程研究中心 | 吉林省金属材料及加工技术工程研究中心 |
| 吉林省汽车摩擦材料生产技术与装备工程研究中心 | |
| 省级研究机构（吉林省中医药管理局主管） | |
| 吉林省糖尿病中医病机辩证与中药研发重点研究室 | 吉林省心血管中药作用机制及临床观察重点研究室 |
| 吉林省中医药免疫效应重点研究室 | 吉林省中药药理重点研究室 |
| 免疫疾病研究室 | 肾病研究室 |
| 药理研究室 | 脑肿瘤疾病研究室 |
| 耳鼻咽喉疾病二级实验室 | 肝病二级实验室 |
| 脑病二级实验室 | 周围神经损伤与再生二级实验室 |
| 中药毒理二级实验室 | 病理生理二级实验室 |
| 病理二级实验室 | 基因工程制药二级实验室 |
| 病原微生物二级实验室 | 中药生物工程二级实验室 |
| 中药药理二级实验室 | 组织与细胞化学二级实验室 |
| 天然药物活性成分分析二级实验室 | 生物药学二级实验室 |
| 中药制剂二级实验室 | |
| 吉林省高校重点实验室（吉林省教育厅主管） | |
| 应用有机化学重点实验室 | 生物制药工程重点实验室 |
| 软件新技术重点实验室 | 表面与界面化学重点实验室 |
| 汽车能源与动力重点实验室 | 智能化农业装备与技术重点实验室 |
| 工程装备先进设计制造技术重点实验室 | 水资源与水环境重点实验室 |
| 动物胚胎工程重点实验室 | 神经病学和神经病科学重点实验室 |
| 油页岩与共生矿产成矿及勘查开发重点实验室 | 组织修复与重建重点实验室 |
| 数量化科学计算重点实验室 | 作物基因工程重点实验室 |
| 血液病和肿瘤学重点实验室 | |
| 吉林省高校工程研究中心 | |
| 金属矿产资源勘查技术与评价工程研究中心 | |
| 吉林省国际科技合作基地（吉林省科技厅主管） | |
| 吉林省转化医学国际科技合作基地 | |
| 吉林省地下新能源开发与地质环境修复国际科技合作基地 | |
| 吉林省现代农业推广国际科技合作基地 | |
| 吉林省干细胞转化医学国际科技合作基地 | |
| 吉林省工程仿生国际科技合作基地 | 吉林省空腔生物医学国际联合研究中心 |
| 吉林省肝胆胰外科国际科技合作基地 | |
| 吉林省重大心血管疾病预防、诊断和治疗国际科技合作基地 | |
| 吉林省计算系统生物学国际科技合作基地 | 吉林省食源性寄生虫病研究国际科技合作基地 |
| 吉林大学哲学社会科学重点研究基地 | |
| 社会公正与政府治理研究中心 | 创新创业研究院（下设创新管理研究中心、创业研究中心、中以创新创业合作研究中心） |
| 中国古文字研究中心 | 东北文化与社会发展研究中心 |
| 中俄区域合作研究中心 | 中国特色社会主义理论体系研究中心 |
| 中日经济共同研究中心 | 高句丽渤海研究中心 |
| 其他科研机构、实验室 | |
| 东北亚研究院 | |
| 古籍研究所 | |
| 高等教育研究所 | 国际关系研究所 |
| 南方研究院（深圳研究院） | 全面依法治国重大问题研究中心 |
| 边疆考古与中国文化认同协同创新中心 | 国家治理协同创新中心 |
| 中国外交理论与实践协同创新中心 | 社会发展研究中心 |
| 东北历史与疆域研究中心 | 知识经济研究中心 |
| 信息资源研究中心 | 中国当代马克思主义文艺学研究中心 |
| 妇女研究中心 | 中国与周边国家区域合作研究中心 |
| 中国人口老龄化与经济社会发展研究中心 | 残疾人事业发展研究中心 |
| 民族研究所 | 农村发展研究中心 |
| 农村金融研究中心 | 东北亚地缘政治经济研究所 |
| 粤港澳台区域合作与发展研究中心 | 中国科技政策与科技管理研究中心 |
| 文化遗产保护研究中心 | 吉林省长吉图开发开放研究中心 |
| 吉林大学-加州州立大学中美比较管理联合研究中心 | 俄罗斯现代化研究中心 |
| 中国地方政府创新研究中心 | 日本研究所 |
| 俄罗斯研究所 | 朝鲜研究所 |
| 韩国研究所 | 蒙古研究所 |
| 欧洲研究所 | 美国研究所 |
| 中国区域社会史研究中心 | 体育与健康管理研究中心 |
| 中国企业社会风险与责任研究中心 | 认知美学与美育研究中心 |
| 教育与现代产业发展研究院 | 信息化与信息管理研究中心 |
| 吉林大学（中国）—西蒙菲莎大学（加拿大）生物考古学联合实验室 | 廉政研究院 |
| 日本侵华史研究中心 | 北极研究所 |
| 东北亚国际语言文化研究中心 | 高校外语教育研究中心 |
| 劳动关系研究院 | 吉林大学—中国（海南）改革发展研究院经济政策定量研究中心 |
| 东北振兴发展研究院 | |
| 吉林大学国家发展与安全研究院 | |
| 理论化学研究所 | 原子与分子物理研究所 |
| 辊锻工艺研究所 | 链传动研究所 |
| 再生医学研究所 | 超塑性与塑性研究所 |
| 数学研究所 | 实验动物中心 |
| 古生物与地层学研究中心 | 人兽共患病研究所 |
| 吉林大学-佐治亚理工学院理论科学联合研究院 | 汽车研究院 |
| 深部探测关键仪器装备研制与实验重大项目管理办公室 | |
| 吉林大学“国家潜在油气资源（油页岩勘探开发利用）”产学研用合作创新基地办公室 | |
| 水资源与环境研究所 | 农业机械工程研究院 |
| 计算机科学技术研究所 | 吉林省地面机械仿生技术与仿生功能材料中试基地 |
| 组合化学与创新药物研究中心 | 东北亚国际地学教学与研究中心 |
| 综合信息矿产预测研究所 | |
| 麦克德尔米德实验室 | 光谱分析研究中心 |
| 矿产资源研究院 | 油页岩合作创新基地 |
| 光谱分析仪器工程技术中心 | 吉林大学组合化学研究中心 |
| 吉林大学车辆检测技术研究与开发中心 | 吉林大学前列腺疾病防治中心 |
| 吉林大学理论物理中心 | 吉林大学汽车运输工程研究中心 |
| 智能仪器与测控技术研究所 | 吉林大学地下能源与废物处置研究所 |
| 吉林省机械化保护性耕作研究中心 | 吉林大学JLU-UPV多孔材料分子工程国际联合实验室 |
